Po téměř 120 letech provozu došlo ke kompletní revitalizaci výpravní budovy budějovického nádraží. Cílem projektu, který si Správa železnic jako investor vytkla na počátku, byla kompletní stavební obnova provozně vytížené budovy a její přizpůsobení požadavkům moderní železnice 21. století.
Při úvahách, zda rekonstruovat historickou výpravní budovu v Radotíně, nebo vystavět novou, se ukázalo, že stávající budova není schopna pojmout nynější provoz a intenzitu pohybu cestujících v rámci stanice. Jedná se o variantu, která je také cenově výhodnější.